در حالی‌که گزارش‌های زیادی از دست‌کاری مواد درسی و آموزشی در مکاتب و دانشگاه‌ها از سوی طالبان وجود دارد و گفته می‌شود که مراکز آموزشی به مدارس دوم تبدیل شده‌اند، وزیر تحصیلات این گروه مدعی شده که آنان متعهدند کیفیت تحصیلات عالی را بالا ببرند.
ندا محمد ندیم، به‌تازه‌گی گفته که این گروه برنامه‌هایی را برای ارتقای ظرفیت استادان دانشگاه‌ها روی دست گرفته است.
او که در برنامه آغاز کار ساخت شفاخانه تدریسی دانشکده طب دانشگاه قندهار شرکت و سخنرانی کرده بود، این اظهارات را مطرح کرده است.
طالبان در بیش‌تر از دو سال تسلط خود بر افغانستان، تغییراتی را در مواد درسی مکاتب و دانشگاه‌ها اعمال کرده‌اند که با انتقادات زیادی مواجه شده است.
برخی به این باورند که دست‌کاری نصاب آموزشی به بهانه افزودن مضامین دینی از سوی طالبان که هیچ تخصصی در این زمینه ندارند، ضربه سنگین و جبران‌ناپذیری را به نظام آموزشی و تحصیلی کشور وارد می‌کند.
افزون بر این، طالبان با برگشت به قدرت، مکاتب را به‌روی دختران بالاتر از صنف ششم بستند و به تعقیب آن دانشجویان دختر را نیز از رفتن به دانشگاه منع کردند.
